W grze występuje pięć frakcji: cztery występujące w poprzednich częściach, czyli Przystań, Inferno, Nekropolia i Twierdza, a także jedna nowa: Świątynia, zamieszkiwana przez frakcję nagów. Przez całą grę wspomina się także o dwóch innych frakcjach, Irollan i Siedmiogrodzie, jednak nie pojawiają się one w grze (jedynie podczas kampanii Nekropolii jedna misja toczy się w Siedmiogrodzie). Wspomina się też o tzw. Bezimiennych, występuje także trzech ich bohaterów: Bibliotekarz, Raelag i Katarzyna.
Przystań Przystań (a dokładniej Święte Cesarstwo) jest frakcją zamieszkaną głównie przez ludzi. Wzorowani są oni na Rzymie u schyłku starożytności. W Świętym Cesarstwie panuje władza federalna, państwo jest podzielone na kilkanaście księstw wzorowanych na realnych krajach (np. Księstwo Wilka wzorowane jest na Niemczech, Księstwo Byka na Włochach i Hiszpanii, a Księstwo Gryfa – na słowiańskiej Europie). Nadrzędną władzę sprawuje Imperator Liam, pod koniec gry pojawia się także nowa władczyni: Cesarzowa Gwendolyn. Wojska Świętego Cesarstwa skupiają się przede wszystkim na wzmacnianiu i leczeniu.