Atak Niemiec w 1939 roku i okupacja uniemożliwiły dalsze funkcjonowanie oddziału. Niemcy zniszczyli bogatą bibliotekę, zlikwidowano muzeum, zdołano zabezpieczyć tylko niektóre eksponaty w tym skarb kunowski – 73 dukatów złotych i 843 srebrnych monet. Hitlerowcy zamordowali głównych działaczy Stanisława Saskiego i Stanisława Żakowskiego, w Oświęcimiu zginął Franciszek Kubala. Wielu innych zmarło lub wyjechało z Ostrowca. Działalność zamarła na dziesięć lat, a jej wznowienie nastąpiło 23 kwietnia 1948 roku z inicjatywy przedwojennych działaczy: Maryli Żakowskiej, Stanisława Jeżewskiego i Jana Szymańskiego.
Oddział Polskiego Towarzystwa Turystyczno-Krajoznawczego 17 grudnia 1950 roku powstał oddział Polskiego Towarzystwa Turystyczno-Krajoznawczego, będący kontynuatorem 37-letniej działalności PTK w Ostrowcu Świętokrzyskim.