Pomimo tego po tytuł sięgnął dopiero w ostatnim wyścigu, za sprawą niezwykle równego i konsekwentnego Japończyka Noriyuki Hagi.

MotoGP Amerykanin po raz pierwszy w MotoGP pojawił 22 czerwca 2008 roku, podczas GP Wielkiej Brytanii, w zastępstwie kontuzjowanego Włocha Lorisa Capirossiego. Wyścig ostatecznie zakończył na 14. miejscu. W tym samym sezonie wystąpił jeszcze dwukrotnie na motocyklu Suzuki, podczas rodzimych GP USA oraz GP Indianapolis. Na dobrze znanych przez siebie obiektach spisał się znakomicie, zajmując 8. i 6. pozycję. W ciągu trzech wyścigu uzyskał pulę 20 punktów, dających mu 19. lokatę w końcowej klasyfikacji.

W roku 2009 za sprawą świetnych osiągów w WSBK, dostał szansę startu w kończącej sezon GP Walencji. Ponownie potwierdził swój talent, dojeżdżając na bardzo dobrym 7. miejscu. Dorobek 9 punktów dał mu 20. pozycję na koniec sezonu.

Dzięki zdobyciu tytułu mistrzowskiego w Mistrzostwach Świata Superbike’ów, Ben Spies podpisał kontrakt z satelicką ekipą Yamahy – Tech3 – na sezon 2010.