W tym samym roku Olimpiada została objęta patronatem Bronisława Kamińskiego, ówczesnego Ministra Ochrony Środowiska i Zasobów Naturalnych. W 1993 roku afiliowano ją przy Szkole Głównej Gospodarstwa Wiejskiego jako placówce merytorycznej oraz wpisano do rejestru stałych konkursów i olimpiad. mały|Laureaci Olimpiady Wiedzy Ekologicznej podczas wyjazdu na Maderę, stanowiącego nagrodę główną XXXVII edycji Olimpiady (2023). Od XVIII edycji, zorganizowanej w 2003 r., Toyota Motor Poland pełni rolę sponsora strategicznego oraz współorganizatora Olimpiady, wspierając zarówno jej organizację, jak i fundując nagrody rzeczowe oraz wyjazdy dla laureatów. Jubileuszowy, 25 finał odbył się w dniach 4-6 czerwca 2010 w Białowieży. 30 finał odbył się w Olsztynie. Do 2022 roku w Olimpiadzie wzięło udział ponad półtora miliona uczniów.
Wśród finalistów i laureatów Olimpiady znajdowały się osoby istotne dla obszaru ochrony środowiska, m.in. Piotr Otawski czy Maciej Trzeciak.