Istnieje także możliwość wprowadzenia do gry własnej cywilizacji, którą gracz chciałby prowadzić.
Poziomy trudności W porównaniu z poprzednią wersją, istnieje o jeden poziom trudności więcej. Oprócz Wodza, Dowódcy, Księcia, Króla i Cesarza istnieje też najtrudniejszy poziom Bóstwo.
Zasady gry Do drugiej wersji Civilization została dołączona możliwość modyfikowania zasad gry. Gracz może: wybierać przeciwników komputerowych, nie zezwalać na pojawianie się nowych cywilizacji po wyeliminowaniu kolejnego przeciwnika, wyłączyć/włączyć opcję zakończenia gry przez lot na Alfa Centauri, zdefiniować świat jako płaski, wybrać formę uproszczonej walki, wybrać rok rozpoczęcia od 4000 p.n.e. do 2000 p.n.e. (wersja przyspieszona).
Scenariusze i utworzone światy Rozpoczynając grę, gracz może rozpoczynać, jak w poprzedniej wersji, w roku 4000 p.n.e., ale również można wybrać scenariusz w utworzonym świecie. Tworzenie własnych światów umożliwia, m.in. edytor map. Do gry dodane zostały dwa scenariusze – jeden z czasów Imperium rzymskiego i drugi z okresu drugiej wojny światowej. Poza tym dołączone zostały też utworzone światy zamykające się w granicach Europy, Grecji czy ziemskiego globu.