Terytorium parafii nie uległo zmianom aż do XIX wieku, kiedy to przyłączono Garbary, Groblę, ul. Wszystkich Świętych oraz północną część Rynku Bernardyńskiego. W 1974 roku część parafii znalazła się w granicach nowoerygowanej przy kościele św. Franciszka Serafickiego. Kolejna zmiana granic miała miejsce w1979 roku w związku z powołaniem przy kościele pw. Wszystkich Świętych ośrodka duszpasterskiego, a później właściwej parafii.
Od 1937 roku w kościele obecna jest całodzienna adoracja Najświętszego Sakramentu. W latach 1945–1956 kolegiata pełniła funkcje prokatedry. W 1952 roku za czasów posługi ks. Józefa Janego zainicjowano we farze kult Matki Bożej Nieustającej Pomocy. W 1961 roku abp Antoni Baraniak dokonał koronacji wizerunku Maryi. W 2010 roku papież Benedykt XVI uhonorował kościół tytułem bazyliki mniejszej. W parafii funkcjonuje także stały dyżur spowiedzi od 6:30 do 19:00.