Georga von Trappa fascynowały okręty podwodne; w roku 1908 skorzystał z okazji i przeniósł się do nowo powstałej jednostki U-Boot-Waffe. W roku 1910 przejął dowództwo na nowo skonstruowanym okręcie U-6, którego matką chrzestną została Agathe Whitehead, wnuczka Roberta Whiteheada, wynalazcy torpedy. Georg von Trapp dowodził U-6 aż do roku 1913. W okresie I wojny światowej dowodził okrętami i U-14, stając się asem wojny podwodnej. 1 maja 1918 roku został awansowany do stopnia komandora podporucznika (niem. Korvettenkapitän).
Pierwsze małżeństwo W styczniu 1911 roku, von Trapp ożenił się z Agathe Whitehead, która wniosła obfity posag. 1 listopada 1911 narodził się ich pierwszy syn, Rupert von Trapp, w miasteczku Pula, na terenie dzisiejszej Chorwacji.