W ostatnich latach, staraniem proboszczów parafii, przeprowadzane są gruntowne prace konserwatorskie kościoła. W 2022 roku parafianie zawiadomili Kurię Diecezji Radomskiej oraz prokuraturę, że ówczesny ksiądz proboszcz przestał spłacać pożyczki zaciągnięte w banku oraz u wiernych. Śledztwo od 2024 roku toczy się w Prokuraturze Okręgowej Radomiu. Prowadzone jest w kierunku "nadużycia udzielonych uprawnień oraz niedopełnienia ciążących obowiązków przez osobę zobowiązaną do zajmowania się sprawami majątkowymi parafii Św. Krzyża w Kozienicach i dotyczy okresu od grudnia 2012 do lutego 2023 roku", w tym wyrządzenia szkody majątkowej wielkiej wartości w kwocie nie mniejszej niż 1 mln 938 tys. zł, które zostały wydane na cele prywatne. Ksiądz Kazimierz Ch. został odwołany przez biskupa radomskiego i przeniesiony na emeryturę do Domu Księży Seniorów. Remont jest kontynuowany przez kolejnego proboszcza.
Grupy parafialne Apostolat Margaretka koło biblijne parafialny zespół Caritas diakonia muzyczna Koło Przyjaciół Radia Maryja koła Żywego Różańca Rycerze Kolumba Wspólnota Chrystusa Zmartwychwstałego Galilea LSO schola Skauci Europy