FK Vojvodina 3,050 FC Honka 1,958 FK Sevojno 3,050 NK Interblock 1,816 Maccabi Netanja 3,050 Budapest Honvéd FC 1,633 Bene Jehuda Tel Awiw 3,050
Pogrubiono nazwy drużyn, które awansowały do rundy play-off.
Runda play-off Do startu w rundzie play-off uprawnionych było 76 drużyn (w tym 35 zwycięzców III rundy kwalifikacyjnej Ligi Europy i 15 przegranych III rundy kwalifikacyjnej Ligi Mistrzów), z czego 38 było rozstawionych. Losowanie odbyło się 7 sierpnia 2009 (godz. 13:00). W jego trakcie wszystkich uczestników rundy podzielono przed nim na 8 grup (z czego w sześciu umieszczono po 5 drużyn rozstawionych i nierozstawionych, a w dwóch po 4 rozstawione i nierozstawione), w których drużyny zostały rozlosowane między sobą. Pierwsze mecze rozegrano 20 sierpnia, rewanże – 25 i 27 sierpnia 2009.
Na żółtym tle przedstawiono drużyny, które awansowały z III rundy kwalifikacyjnej Ligi Europy. Na różowym tle przedstawiono drużyny, które przegrały w III rundzie kwalifikacyjnej Ligi Mistrzów.
Grupa 1 Drużyny rozstawione Drużyny nierozstawione Drużyna Współcz. Drużyna Współcz. Werder Brema 91,339 Heart of Midlothian 11,575 Everton 35,899 PAOK FC 9,633 Heerenveen 33,826 BATE Borysów 7,733 Dinamo Zagrzeb 16,466 Sigma Ołomuniec 4,150 Liteks Łowecz 16,250 FK Aktöbe 0,649