Latem 2003 roku Gökhan odszedł z Gençlerbirliği do Kayseri Erciyessporu. W nowej drużynie zadebiutował 9 czerwca 2003 roku w przegranym 0:2 wyjazdowym meczu z Antalyasporem. W sezonie 2003/2004 zdobył 11 bramek w drugiej lidze Turcji i awansował ze swoim zespołem do pierwszej ligi. Wtedy też Kayseri Erciyesspor został przemianowany na Kayserispor. W sezonie 2005/2006 z 25 zdobytymi golami został królem strzelców ligi, a Kayserispor zajął 5. miejsce. Latem 2006 awansował z Kayserisporem do Pucharu UEFA poprzez wygranie finału Pucharu Intertoto. W 2007 i 2008 roku ponownie był z klubem z Kayseri 5. w lidze, a w 2008 roku zdobył Puchar Turcji, dzięki zwycięstwu w finale 11:10 po serii rzutów karnych z Gençlerbirligi. Do lata 2008 rozegrał w barwach Kayserisporu 135 spotkań i zdobył 78 bramek.
Kolejnym klubem w karierze Gökhana został Trabzonspor. 24 sierpnia 2008 w debiucie z Ankarasporem (2:0) zdobył gola, a w całym sezonie 2008/2009 strzelił 15 bramek będąc najlepszym strzelcem Trabzonsporu i przyczyniając się do zajęcia 3. miejsca w lidze przez tę drużynę.