W 1983 podczas zgromadzenia plenarnego Światowej Rady Kościołów w Vancouver została najmłodszym członkiem komitetu centralnego Rady. Zrezygnowała z funkcji w 2002 po tym, jak specjalna komisja ds. członkostwa Kościołów prawosławnych w ŚRK zarekomendowała odrzucenia zwrotu „nabożeństwo ekumeniczne” i zastąpienie go zwrotem „międzywyznaniowa modlitwa powszechna”. Biskup zasiada w komitecie centralnym Konferencji Kościołów Europejskich.
20 lutego 2010 hanowerski patrol policyjny zatrzymał Margot Käßmann, gdy ta służbowym samochodem przejechała przez skrzyżowanie na czerwonym świetle. Badania laboratoryjne wykazały, że we krwi miała 1,54 promila alkoholu. Cztery dni później, mimo votum zaufania ze strony władz EKD, złożyła obydwa sprawowane przez siebie urzędy.
Poglądy Zdaniem byłej zwierzchniczki hanowerskiego Kościoła w naukach przedkonfirmacyjnych zbyt mało mówi się o Biblii, a zbyt dużo o tematach współczesnych, jak sekty czy narkotyki. Margot Käßmann kładzie szczególny nacisk na rolę modlitwy w życiu dzieci i dorosłych chrześcijan. Publicznie nawoływała do delegalizacji Narodowo-Demokratycznej Partii Niemiec. Znana jest z ostrej krytyki Watykanu w sprawie nauczania Kościoła rzymskokatolickiego nt.