Rozwój organizacji kościelnej thumb|Zasięg archidiecezji praskiej ok. 1400 roku na tle obecnych granic Czech W 1459 r. król Czech Jerzy z Podiebradów przekształcił ziemię kłodzką w samodzielne hrabstwo kłodzkie, w którym rządy objął jego ród PodiebradowiczówTadeusz Broniewski, Kłodzko. Śląsk w zabytkach sztuki, wyd. Ossolineum, Wrocław 1970, s. 7.. Pod koniec XV w. sieć parafialna była już na tym terenie bardzo dobrze rozwiniętaKazimierz Bartkiewicz, Dzieje ziemi kłodzkiej w wiekach średnich, wyd. Ossolineum, Wrocław 1977, s.. 24 stycznia 1631 r. dziekan Hieronymus Keck został mianowany pierwszym wikariuszem biskupim dla hrabstwa kłodzkiego. Świadczyło to o silnej pozycji kłodzkiego duchowieństwa.
Powstanie wielkiego dekanatu W wyniku wojen śląskich (1740–1763) dekanat kłodzki znalazł się pod panowaniem pruskim, co potwierdził zawarty w 1763 r. pokój w HubertusburguHistoria Śląska, pod red. M. Czaplińskiego, wyd. UWr, Wrocław 2002, s.. Pomimo zmiany przynależności państwowej ziemia kłodzka pozostała w granicach archidiecezji praskiej. Wybór dziekanów kłodzkich pozostawał w gestii króla pruskiego. Więzy łączące ziemię kłodzką od kilku stuleci uległy rozluźnieniu, wobec tego w 1789 r.