21 goli Giorgi Demetradze (Ałanija) 19 goli Andriej Tichonow (Spartak) 15 goli Władimir Kulik (CSKA) 14 goli Dmitrij Łośkow (Lokomotiw M.) Oleg Teriochin (Dinamo Moskwa) 13 goli Arsen Awakow (Lokomotiw N.N.) 12 goli Wiaczesław Kamołcew (Torpedo) Siergiej Siemak (CSKA) Oleg Wierietiennikow (Rotor) 11 goli Jegor Titow (Spartak)
Nagrody 2 grudnia 1999 Rosyjski Związek Piłki Nożnej wybrał listę 33 najlepszych piłkarzy ligi za sezon 1999:
Bramkarze Aleksandr Filimonow (Spartak) Rusłan Nigmatullin (Lokomotiw M.) Roman Berezowski (Zenit)
Prawi obrońcy Dmitrij Parfionow (Spartak) Walerij Mińko (CSKA) Aleksiej Arifullin (Lokomotiw M.) Prawi-środkowi obrońcy Dmitrij Chlestow (Spartak) Igor Czeriewczenko (Lokomotiw M.) Wiaczesław Dajew (Torpedo)
Lewi-środkowi obrońcy Igor Czugajnow (Lokomotiw M.) Wiktor Bułatow (Spartak) Jewgienij Warłamow (CSKA) Lewi obrońcy Siarhiej Hurenka (Lokomotiw M.) Jurij Kowtun (Spartak) Oleg Kornauchow (CSKA)
Prawi pomocnicy Siergiej Siemak (CSKA) Albert Sarkisjan (Spartak) Aleksandr Gorszkow (Zenit) Prawi-środkowi pomocnicy Aleksiej Smiertin (Lokomotiw M.) Jurij Drozdow (Lokomotiw M.) Dmitrij Chomucha (CSKA)