12 maja – wtorek 9:00 – odwiedziny Wzgórza Skały na dziedzińcu meczetu jerozolimskiego, wizyta u wielkiego muftiego na dziedzińcu meczetu, przemówienie papieża, 10:00 – odwiedziny Zachodniego Muru (Ściana Płaczu), 10:45 – wizyta kurtuazyjna u dwóch wielkich rabinów Jerozolimy w Ośrodku Hechal Szlomo, przemówienie papieża, 11:50 – modlitwa Regina Caeli z udziałem ordynariuszy z Ziemi Świętej na terenie Wieczernika, przemówienie papieża, 12:30 – krótka wizyta w konkatedrze łacińskiej, 13:00 – obiad z ordynariuszami z Ziemi Świętej, opatami i orszakiem papieskim w siedzibie Patriarchatu Łacińskiego, 16:30 – msza w Dolinie Jozafata, kazanie papieża.
Betlejem 13 maja – środa 9:00 – powitanie papieża na placu przed Pałacem Prezydenckim, przemówienie papieża, 10:00 – msza na placu Żłóbka, kazanie papieża, 12:30 – obiad z ordynariuszami z Ziemi Świętej, ze wspólnotą franciszkańską i z orszakiem papieskim w konwencie Nowego Domu, 15:30 – wizyta prywatna w Grocie Narodzenia, 16:10 – odwiedziny szpitala dziecięcego Caritas, 16:45 – odwiedziny Obozu Uchodźców Aida, przemówienie papieża, 18:00 – wizyta kurtuazyjna u prezydenta Narodowej Władzy Palestyńskiej w Pałacu Prezydenckim, 18:40 – pożegnanie na dziedzińcu pałacu Prezydenckiego, przemówienie papieża.