Często malował na miedzi.
Jeden z obrazów van Baburena – U stręczycielki (1622), który prawdopodobnie należał wówczas do teściowej Jana Vermeera – mógł stać się inspiracją dla mistrza z Delftu do namalowania w 1656 płótna pod takim samym tytułem. Ponadto Vermeer dwukrotnie wykorzystał motyw tegoż obrazu van Baburena, umieszczając go w tle dwóch innych swoich obrazów: Koncert (ok. 1665–1666) i Dziewczyna siedząca przy klawesynie (1673–1675).
Wybrane dzieła Chłopiec grający na drumli (1621) – Utrecht, Centraal Museum Chrystus umywa nogi apostołom (ok. 1616) – Berlin, Gemäldegalerie Chrystus wśród uczonych (ok. 1622) – Bloomington, Indiana University Art. Museum Cierniem koronowanie (1623) – Utrecht, Museum Catharijneconvent Heraklit i Demokryt – Kowno, Muzeum Ciurlioniosa Koncert (ok. 1623) – Petersburg, Ermitaż Pojmanie Chrystusa (ok. 1619) – Rzym, Galeria Borghese Prometeusz skowany (1623) – Amsterdam, Rijksmuseum U stręczycielki (1622) – Boston, Isabella Stewart Gardner Museum Tytus (1622) – Berlin, Zamek Gruenewald Zaparcie się