Jako nastolatek zbuntował się przeciwko rodzicom i obecnej w domu religijnej tradycji. Porzucił religię i przestał uczestniczyć w rytuałach religijnych. Zapisał się do Klubu Ateistów i Wolnomyślicieli. W 1948 zapisał się do Związku Młodzieży Polskiej. Jako aktywista ZMP wniósł skargę do dyrekcji I Liceum Ogólnokształcącego w Krakowie na ucznia Stefana Maciejewskiego, w następstwie której Maciejewski został wyrzucony z liceum. Jerzy Vetulani został usunięty z ZMP wskutek literówki zrobionej w artykule do gazetki szkolnej, gdy w jednym z tekstów zamiast „podstawy socjalizmu” przez pomyłkę napisał „podsrawy socjalizmu”. W rozmowie z Maciejem Zborkiem stwierdził, że nie żałuje tego, że był w ZMP.
1952–1973: Studia, kabaret, Instytut Farmakologii thumb|upright|Jerzy Vetulani ukończył biologię i chemię na Uniwersytecie Jagiellońskim. Po tragicznej śmierci brata obronił w 1966 doktorat (lata 60. XX wieku) W 1952 rozpoczął studia biologiczne na Uniwersytecie Jagiellońskim ze specjalnością fizjologia zwierząt. Wśród jego wykładowców byli m.in. Andrzej Pigoń, Maria Skalińska, Zygmunt Grodziński i Stanisław Smreczyński. W 1953 został członkiem zarządu Koła Przyrodników Studentów UJ pierwszego roku Wersja zarchiwizowana..