Od 1946 r. umysłowe, teologiczne wsparcie działalności Światowej Rady Kościołów (ŚRK), zapewniał Bossejski Instytut Ekumeniczny, powołany z inicjatywy jej pierwszego sekretarza Willema Visser ’t Hoofta. Np. w 1954 r. grupa 25 teologów Instytutu opracowała główny temat obrad Ewanstońskiego Zgromadzenia Ogólnego ŚRK.
Rada włączyła się w działalność Globalnego Forum Chrześcijańskiego.
Struktury siedziba organizacji mieści się w Genewie. Na czele rady stoi Komitet Naczelny, wybierany co 7 lat. W sierpniu 2009 na kolejnego sekretarza generalnego został wybrany pastor luterański dr Olav Fykse Tveit z Kościoła Norwegii. Wcześniej funkcję tę pełnili m.in. Konrad Raiser (1993–2003) i Samuel Kobia (2003–2010).
Kościoły członkowskie Światowa Rada Kościołów zrzesza 354 (sierpień 2006) różne Kościoły chrześcijańskie (z ponad 110 krajów, ponad 500 mln wiernych) z różnych tradycji: protestanckiej (obecnie ponad 90%), prawosławnej (mimo poparcia większości autokefalii dla ruchu ekumenicznego, niektóre z nich go negują), anglikańskiej, starokatolickiej, przedchalcedońskiej.
Polskie Kościoły wchodzące w skład Rady: Polski Autokefaliczny Kościół Prawosławny, Kościół Ewangelicko-Augsburski w RP, Kościół Starokatolicki Mariawitów w RP, Kościół Polskokatolicki w RP.