Dwie stałe komisje kierują raporty bezpośrednio do Biura: Stała Komisja ds. Spraw Instytucjonalnych, która skupia się na popieraniu rdzennych zasad subsydiarności, dobrego zarządzania i regionalnej demokracji; Stała Komisja ds. Monitoringu i Ewaluacji, która skupia się na podtrzymywaniu priorytetów określonych w planie strategicznym. Prezydium Prezydium składa się z Prezydenta AER (obecnie Michèle Sabban, Wiceprezydent regionu Île-de-France), dwóch Wiceprezydentów, Wiceprezydenta Skarbnika oraz Prezydentów poszczególnych komitetów AER. W okresie przejściowym między spotkaniami Biura, przez delegację, Prezydium może się spotkać i podjąć decyzje, które są następnie przedkładane Biuru.
Struktura komisji Komisja 1 : Ekonomia i Rozwój Regionalny Regionalny rozwój ekonomiczny, zatrudnienie, społeczeństwo wiedzy, środowisko, energia, rozwój terenów wiejskich/ rolnictwa oraz infrastruktury, turystyka. Komisja 2 : Polityka Społeczna i Zdrowie Publiczne Polityka społeczna, równe szanse, demografia, zdrowie publiczne oraz planowanie w sytuacjach wyjątkowych. Komisja 3 : Kultura, Edukacja i Młodzież Kultura, edukacja, szkolenia, młodzież, media, technologie informacyjne, międzynarodowa i międzyregionalna współpraca. Podkomisje Prezydenci Komisji/Stałych Komisji są odpowiedzialni za ustanawianie podkomisji uznanych za