Wziął udział w 28 pojedynkach drugiej ligi i razem z ekipą „Rossoblu” uplasował się na siódmej pozycji w tabeli.
Latem 2007 roku Manfredini podpisał kontrakt z pierwszoligową Atalantą BC. W lipcu 2007 roku został zawieszony przez włoską federację na trzy miesiące za udział w nielegalnych zakładach sportowych. W nowym klubie ligowy debiut zaliczył 4 listopada, a „Nerazzurri” wygrali wówczas na wyjeździe z Catanią 2:1. Przez cały sezon włoski piłkarz rozegrał w lidze siedemnaście spotkań i nie zdobył ani jednego gola. Sezon 2008/09 rozpoczął jako podstawowy zawodnik swojego zespołu i stworzył linię obrony razem z Gianpaolo Bellinim, Leonardo Talamontim i Györgym Garicsem. W następnym sezonie spadł z Atalantą do Serie B. Jego klub po roku jednak ponownie awansował do najwyższej ligi we Włoszech. W styczniu 2013 roku dołączył do zespołu Genoa CFC. W 2014 roku rozegrał 3 mecze w barwach US Sassuolo Calcio. W styczniu 2015 roku został graczem Vicenzy Calcio. Podczas gry dla tego klubu dwukrotnie zerwał ścięgno Achillesa. Po sezonie 2015/16 rozwiązał swoją umowę i zakończył grę w piłkę nożną. W 2019 roku wznowił karierę i rozegrał 2 spotkania dla SP La Fiorita w Campionato Sammarinese.
Kariera reprezentacyjna Manfredini ma za sobą występy w reprezentacji Włoch-20.