Ostatecznie pod koniec 1954 w organizacji Batalionu Portowego WOP Gdynia występowało 7 strażnic portowych (nr 1, 2, 3, 4, 5 i 6 strażnica ogólnoportowa z ekipami kontrolnymi i kontrolerami oraz nr 7 do kontroli ruchu rybackiego), a w Batalionie Portowym WOP Gdańsk – 4 strażnice (nr 8, 9, 10, i 11 strażnica ogólnoportowa).
Zgodnie z etatem czasu „P” nr 352/20, na dzień 1 listopada 1954 brygada liczyła 3709 żołnierzy, a etat czasu „W” nr 0352/176 przewidywał 3865 żołnierzy.
1 lipca 1956 został rozformowany 162 batalion WOP w Sopocie.
1 czerwca 1957 161 batalion WOP w Lęborku został podporządkowany dowódcy 15 Brygady WOP w Koszalinie.
Zgodnie z etatem czasu „P” nr 352/41, na dzień 1 sierpnia 1957 brygada liczyła 2701 żołnierzy, a etat czasu „W” nr 0352/23 przewidywał 2127 żołnierzy.
Rozformowana 1 stycznia 1958. Na jej bazie powstała 16 Kaszubska Brygada WOP.
Skład organizacyjny Organizacja 16 Brygady WOP z 1951 Dowództwo 16 Brygady WOP w Gdańsku 161 batalion WOP w Lęborku 162 batalion WOP w Sopocie 163 batalion WOP w Sztutowie batalion portowy WOP Gdynia w Gdyni batalion portowy WOP Gdańsk w Gdańsku-Nowym Porcie Fotylla Okrętów Pogranicza w Gdańsku-Westerplatte pododdziały dowodzenia.