Malta w Konkursie Piosenki Eurowizji Junior zadebiutowała w 2003 roku. Od czasu debiutu konkursem w kraju zajmuje się maltański nadawca publiczny Public Broadcasting Services (PBS).
Malta dwukrotnie wygrała finał konkursu: w 2013 (Gaia Cauchi z piosenką „The Start”) i w 2015 (Destiny Chukunyere z „Not My Soul”).
Historia Malty w Konkursie Piosenki Eurowizji Junior Konkurs Piosenki Eurowizji Junior 2003 2 maja 2003 maltański nadawca potwierdził, że zadebiutuje w inauguracyjnym 1. Konkursie Piosenki Eurowizji Junior, publikując regulamin selekcji Junior Song For Europe 2003. Termin nadsyłania zgłoszeń zakończył się 15 lipca 2003. 28 lipca do finału selekcji zakwalifikowali się: Christabelle Borg („Smile”), Marilena Gauci („This Is Our Heaven”), Brooke Borg i Brendan („Like a Butterfly”), Decoda Buttigieg („Little Angel), Kylie Coleiro („Share the Joy”), Ylenia („In Love Unite”), Klinsmann Coleiro („Where There’s a Will”), Christine Barbara („My Dear Imaginary Friend”), Sarah Harrison („Like a Star”) oraz Leanne Ellul („Prayer for Peace”).