Zapasowy pułk saperów prowadził również akcję rozminowania. Brały w niej udział głównie dwa bataliony — 899 żołnierzy. Rozminowanie prowadził pułk w 2 etapach. Pierwszy etap rozpoczęto w okolicach Dębicy, Tarnowa, drugi na terenie południowej części województwa krakowskiego w rejonach Bielska i w okolicach granicy z Czechosłowacją. W czasie rozminowania pododdziały pułku sprawdziły 14 399 ha ziemi, 2000 miejscowości, 51 miast, 8306 km dróg. Unieszkodliwiły około 160 000 min, 914 bomb lotniczych oraz około 200 tys. sztuk różnej amunicji. Podczas rozminowania straty pułku wyniosły 16 zabitych (w tym: 3 oficerów i 9 podoficerów) i 36 rannych żołnierzy. Akcję rozminowania pułk zakończył w pierwszych dniach września 1945.
Zgodnie z rozkazem 2 Zapasowy Pułk Saperów rozformowano do 15 września 1945, a jego skład osobowy i sprzęt wykorzystano na uzupełnienie innych jednostek saperskich. Przez szeregi 2 zpsap, głównie jego szkoły podoficerskiej, przeszła znaczna liczba późniejszej kadry oficerskiej wojsk inżynieryjno-saperskich.
Dowódcy ppłk. Piotr Bakutin
Oficerowie ppor. Paweł Targosz – zastępcą ds polityczno-wychowawczych, a od 8 sierpnia 1944 chor. Władysław Mydłowski, ppłk Mikołaj Simończuk – zastępca ds. liniowych, mjr.