Od września 1982 roku przez następne trzy lata pracował jako robotnik w Spółdzielni Inwalidów. Po obronie pracy doktorskiej w 1987 roku został zatrudniony w AWF Wrocław, gdzie pełnił funkcje kierownika Zakładu Historii Kultury Fizycznej. W okresie współpracy z AWF był też przewodniczącym komisji dyscyplinarnej do spraw studentów, oraz uczestniczył w redagowaniu gazety uczelnianej „Życie Akademickie”. Do 2006 roku związany z Uniwersytetem Zielonogórskim – w którym był kierownikiem Zakładu Historii Najnowszej. Od 2004 roku wykładał w Instytucie Dziennikarstwa i Komunikacji Społecznej na Dolnośląskiej Szkole Wyższej we Wrocławiu.
W 2013 otrzymał tytuł profesora.
Wybrane publikacje Profesor Marek Ordyłowski opisał około 40 haseł do Encyklopedii Wrocławia, był autorem 160 publikacji, oraz 7 książek:
„Życie codzienne we Wrocławiu 1945-1956” „Walka z opozycja polityczną na Dolnym Śląsku” „Historia Kultury fizycznej. Starożytność – Oświecenie” „Wieś dolnośląska 1945 – 1956 Władza a społeczeństwo” „1000 lat sportu we Wrocławiu” – współautor „Szkice z dziejów kultury fizycznej” „50 lat Wrocławskiego sportu 1945 – 1995” – współautor (monografie)
Nagrody W 2000 roku Marek Ordyłowski otrzymał nagrodę Ministra Szefa Urzędu Kultury Fizycznej i Sportu.