W październiku 1969 ponownie utworzono 69 Eskadrę, jako drugą formację lotniczą operującą na samolotach myśliwsko-bombowych F-4 Phantom. Ich bazą operacyjną było lotnisko Ramat Dawid. Podczas wojny na wyczerpanie w 1970 roku eskadry 69 i 201 utraciły razem 9 samolotów, ale w lipcu 1970 uzupełniono ich stan o nowych 8 maszyn.
W 1971 siły powietrzne przeznaczyło kilka F-4 Phantom’ów do przeprowadzania zadań rozpoznawczych, zmieniając ich oznaczenie na RF-4E. Po kilku latach samoloty powróciły do swoich dawnych zadań bojowych jako myśliwce bombardujące. Podczas wojny Jom Kipur w 1973 eskadra utraciła 6 samolotów, jednak odniosła 20 powietrznych zwycięstw i przeprowadziła ponad 600 ataków na cele lądowe.
Pod koniec lat 70. XX w. eskadra wielokrotnie przeprowadzała bombardowania pozycji Organizacji Wyzwolenia Palestyny w Libanie. Kumulacją tych operacji była wojna libańska (lata 1982–1985).
W lutym 1998 w skład 69 Eskadry weszły nowe myśliwce przewagi powietrznej F-15I Ra’am, które zastąpiły stare F-4 Phantom’y.