Wydawał w tym czasie „Nakaz Chwili”, pismo w którym publikował artykuły na temat przewidywanej przez niego rewolucji moralnej, która miała nastąpić wraz z wprowadzeniem rządów sanacji. Po zamachu majowym został szefem referatu społecznego w Kancelarii Cywilnej Prezydenta RP. W 1929 r., na skutek infekcji wywołanej gruźlicy, doszło do operacji, podczas której lekarze zmuszeni byli amputować mu obie nogi. Pomimo tego uczestniczył w tworzeniu organizacji antyendeckich młodzieżowych organizacji Legion Młodych i Straż Przednia oraz pisma „Kuźnia Młodych”. Inspirował także utworzenie Centralnego Komitetu dla spraw Młodzieży Wiejskiej i Towarzystwa Wiejskich Uniwersytetów Regionalnych, organizacji dążących do podnoszenia poziomu kulturalnego na wsi.
Zmarł 2 kwietnia 1934 w Warszawie. Spoczywa na cmentarzu Powązkowskim w Warszawie (kwatera 229 przed-3-9). alt=Grób Adama Skwarczyńskiego na warszawskim cmentarzu Powązkowskim|thumb|Grób Adama Skwarczyńskiego na cmentarzu Powązkowskim Publikacje Armja Austro-Węgierska: (na podstawie H. Schmida: Heerwesen. 2, Teil), Warszawa 1916, pod ps. „Adam Płomieńczyk” Józef Piłsudski. Sylwetka wodza legionów, Kijów 1917 Myśli o nowej Polsce, Warszawa 1931 Wskazania, Warszawa 1934 Historia posłuszna woli ludzkiej, Katowice 1986 Adam Skwarczyński – od demokracji do autorytaryzmu (oprac.