dwa lata po narodzinach ich córki – Gemmy Rose (ur. 1.05.2003). Ich syn – James Michael Owen urodził się 6 lutego 2006 roku, natomiast 29 października 2007 roku urodziła się druga córka – Emily May. 26 lutego 2010 roku na świat przyszła trzecia córka Michaela i Louise – Jessica.
W 2004 roku siostra Owena, Karen, została napadnięta przez dwóch nastolatków, którzy próbowali ją porwać. Kiedy ujawniła, że jest w ciąży, uciekli.
Od zakończenia kariery piłkarskiej w 2013 roku, zajmuje się hodowlą i posiadaniem koni wyścigowych, a także regularnie występuje jako komentator sportowy.
W maju 2022 r. krypto kasyno Punt ogłosiło, że Owen został ich najnowszym globalnym ambasadorem marki. W czerwcu 2022 roku Owen został uznany za winnego naruszenia brytyjskich przepisów dotyczących reklamy gier hazardowych, ponieważ wykorzystał swoje konto na Twitterze do promowania wśród Brytyjczyków nielicencjonowanego kasyna kryptowalutowego. Urząd ds.