W 2002 i 2003 roku dwukrotnie z rzędu Hyundai został wicemistrzem Korei. Jeszcze w 2003 roku ponownie został zawodnikiem Yokohamy dokańczając w niej sezon 2003. Został z nią zarówno mistrzem pierwszej, jak i drugiej fazy, a ostatecznie mistrzem 2003 roku J-League. W 2004 roku powtórzył ten sukces. W 2005 roku wrócił do Ulsan. Pod koniec sezonu klub wywalczył swoje drugie mistrzostwo w historii, a w 2006 wygrał A3 Champions Cup. W 2006 Yoo rozegrał tylko jeden mecz w rozgrywkach K-League i postanowił zakończyć piłkarską karierę. Liczył sobie wówczas 35 lat.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1994 Ulsan Hyundai
K-League 26 5 1995 Ulsan Hyundai
K-League 33 2 1996 Ulsan Hyundai
K-League 6 1 1997 Ulsan Hyundai
K-League 17 1 1998 Ulsan Hyundai
K-League 23 15 1999 Yokohama F. Marinos
J-League 22 7 2000 Yokohama F. Marinos
J-League 22 17 2001 Kashiwa Reysol
J-League 24 9 2002 Kashiwa Reysol
J-League 9 5 2002 Ulsan Hyundai
K-League 8 9 2003 Ulsan Hyundai
K-League 10 3 2003 Yokohama F. Marinos
J-League 17 5 2004 Yokohama F.