Sztab główny Carabinieri jest podzielony na 6 departamentów: Departament I – odpowiedzialny za siły operacyjne, treningi dla personelu oraz dyscyplinę zawodową. Departament II – odpowiedzialny za operację oraz dowodzenie, II departamentowi podlega także pokój operacyjny. Departament III – odpowiedzialny za technologię informacyjną, a także telekomunikację. Departament IV – odpowiedzialny za logistykę, dostarczenie sprzętu oraz zaopatrzenia. Departament V – odpowiedzialny za Komunikację oraz Stosunki Ogólne. Departament VI – odpowiedzialny za planowanie budżetu oraz inne kwestie finansowe.
Organizacja terytorialna Siedziby oraz komendy Carabinieri są rozproszone na terenie całego kraju. Organizacje terytorialne stanowią jądro korpusu. W organizacjach terytorialnych jest zatrudnionych ponad 80% wszystkich zatrudnionych w oddziałach Carabinieri. W całym kraju panuję hierarchia administracyjna, w skład której wchodzą następujące organizacje: 5 interregionalnych kwater korpusu Carabinieri dowodzonych przez generała dywizji.