Portugalia w Konkursie Piosenki Eurowizji Junior zadebiutowała w 2006 roku. Od czasu debiutu konkursem w kraju zajmuje się portugalski nadawca publiczny Rádio e Televisão de Portugal (RTP).
Historia Portugalii w Konkursie Piosenki Eurowizji Junior Nadawca transmitował 3. Konkurs Piosenki Eurowizji Junior (2005) i zapowiedział, że zadebiutuje w 2006 roku.
Konkurs Piosenki Eurowizji Junior 2006 11 grudnia 2005 roku portugalski nadawca Rádio e Televisão de Portugal (RTP) potwierdził swój debiut w 4. Konkursie Piosenki Eurowizji Junior. W czerwcu telewizja otworzyła proces zgłoszeń, a termin nadsyłania kandydatur trwał od 17 czerwca do 4 sierpnia 2006. 29 września 2006 odbyły się preselekcje Festival da Canção Junior, w preselekcjach spośród 72 nadesłanych zgłoszeń wyłoniono dziesięciu kandydatów: Mariana António („Só Eu Sei”), Gustavo Almeida, Guilherme Salgueiro i Diogo Farias („História e rapugrafia de Portugal”), Trio da Pop („Ouve o Teu Coração”), Tiago Batista („Só Quero um Mundo Melhor”), Pedro Madeira („Deixa-me Sentir”), Marisa Almeida („Há Sempre uma Canção”), Ana Rita Ribeiro („Uma Canção Fora de Moda”), Daniela Pinto („Tudo o que Penso”) oraz Bárbara Pinho („Nas Noites de Paris”) i Sara Afonso Gonçalves („Folhas de Vento”).