Na oficjalnej stronie zespołu można przeczytać, że "Podstawowy proces twórczy się nie zmienił: Omar tworzył muzykę (w tym dla sekcji dętej), do której Cedric mógłby stworzyć słowa - jednak tym razem mieliśmy swobodę aby udokumentować niezwiązane ze sobą historie, obrazy, żarty, różnych ludzi, wydarzenia i wspomnienia."
Cedric porównywał ten album do serialu Davida Lyncha Miasteczko Twin Peaks, którego odcinki nie przedstawiały jednej historii, a jednak mówiły "jednym głosem". Od czasu ukazania się albumu The Bedlam in Goliath, Bixler-Zavala i Rodríguez-López zaczęli odnosić się do Amputechture jako do swojego "autystycznego dziecka" z powodu przyjęcia tego albumu przez fanów.
Lista utworów "Vicarious Atonement" – 7:19 "Tetragrammaton" – 16:41 "Vermicide" – 4:15 "Meccamputechture" – 11:02 "Asilos Magdalena" – 6:34 "Viscera Eyes" – 9:23 "Day of the Baphomets" – 11:56 "El Ciervo Vulnerado" – 8:50