Historia Firmę w 2001 r. założyło trzech specjalistów IT: Gareth Williams, Barry Smith i Bonamy Grimes, po tym jak pewnej zimy G. Williams, zapalony narciarz, miał ogromne trudności ze znalezieniem tanich lotów do zimowych kurortówHow to launch a great business – SME, Business – The Independent. Pierwszą wersję wyszukiwarki Skyscanner udostępniono w roku 2001 i rozwijano do roku 2002. W 2003 zatrudniono pierwszego pracownika do pomocy przy rozwoju witryny internetowej. W 2004 roku otworzono biuro w Edynburgu i obecnie firma zatrudnia w sumie około 150 osób.
Na początku na stronie internetowej znaleźć można było tylko europejskie tanie linie lotnicze, ale w miarę rozwoju pojawiła się na niej większość przewoźników europejskich, włącznie z British Airways, KLM i Virgin. Skyscanner rozszerzył swój zasięg geograficzny, by włączyć do swojej bazy przewoźników obsługujących trasy do USA i Kanady, także na liniach wewnętrznych tych krajów, jak również przewoźników z innych części świata. Jednak głównie koncentruje się na europejskich portach lotniczych.
Priorytetem firmy jest stanie się wszechstronną kompleksową witryną oferującą każde możliwe połączenie lotnicze.