Drugim podmiotem, którym był zainteresowanym przystąpieniem do rozgrywek A-League w sezonie 2007/2008, była grupa Tropical Football Australia (TFA). TFA zaproponowała klub z siedzibą w Townsville (stan Queensland), jednak ostatecznie FFA odrzuciła tę ofertę. Ostatecznie klub z Townsville – North Queensland Fury FC (oferta zaproponowana przez inny podmiot własnościowy) przystąpił do rozgrywek w sezonie 2009/2010.
A-League Wellington Phoenix zainaugurowało rozgrywki w A-League w dniu 26 sierpnia 2007 roku w domowym spotkaniu przeciwko Melbourne Victory FC. Spotkanie zakończyło się remisem 2:2. Pierwszym trenerem w historii klubu został Ricki Herbert, który prowadził klub w latach 2007–2013. Pierwszym znaczącym sukcesem w historii Wellington Phoenix był awans do finału rozgrywek Pre-Season Challenge Cup w 2008 roku. W finale drużyna z Wellington przegrała po rzutach karnych z Melbourne Victory (mecz zakończył się remisem 0:0, w karnych padł wynik 7:8). Za czasów kadencji Rickiego Herberta klub trzykrotnie wchodził do serii finałowej rozgrywek, odpowiednio w sezonach: 2009/2010, 2010/2011 i 2011/2012. Osiągając najlepszy wynik w sezonie 2009/2010. Wówczas klub dotarł do półfinału serii finałowej, w którym przegrał z Sydney FC w stosunku 2:4.