Największe skupienie wysp występuje w południowej części jeziora Kisajno. Wyspy porośnięte są lasem, w przeważającej mierze pochodzenia sztucznego, o zróżnicowanym składzie gatunkowym. Niewielkie fragmenty są pochodzenia naturalnego. Większe wyspy otoczone są pasami szuwaru. Duża część zbiorowisk jest zniekształcona przez zaśmiecanie, wydeptywanie, palenie ognisk, a niektóre wyspy (np. Duży Ostrów) były w przeszłości użytkowane rolniczo.
Początkowo rezerwat obejmował też wyspy położone na Jeziorze Dobskim, jednak w 1989 roku włączono je do rezerwatu „Jezioro Dobskie”.
Ptaki Stwierdzono tu występowanie ponad 110 gatunków ptaków, gniazdują m.in.: kormoran, perkoz rdzawoszyi, bąk, czapla siwa, tracz nurogęś, błotniak stawowy, żuraw, mewa śmieszka, mewa pospolita, mewa srebrzysta, kania czarna, rybitwa zwyczajna.
Flora lilia złotogłów storczyk plamisty wawrzynek wilczełyko porzeczka czarna kruszyna pospolita kalina koralowa marzanka wonna konwalia majowa
Na terenie rezerwatu można wyróżnić 12 zbiorowisk roślinnych, które można pogrupować na: