Przyznaje Cristinie, iż jest jej przykro z powodu straty mężczyzny, którego Cristina kochała, i który był jej nauczycielem. Cristina prosi ją o zabranie prezentów ślubnych. Po powrocie do mieszkania zastaje je opróżnione z prezentów i rzeczy Burka. Wtedy szefem kardiochirurgii zostaje Erica Hahn, która jest dla Yang bardzo surowa. Cristina za każdym razem próbuje jej zaimponować (z wyjątkiem sytuacji, gdy dowiedziała się, że Burke wygrał nagrodę Harpera Avery’ego).
W piątym sezonie do ekipy chirurgów dołącza dr Owen Hunt, chirurg urazowy, który wrócił z wojny z Iraku. Po jakimś czasie Cristina zaczyna spotykać się z Owenem. Ich problemy w związku są ściśle związane z jego traumą z wojny, lecz para walczy o miłość. Cristina jest pierwszą osobą, której Izzie mówi o swojej chorobie – Yang przekazuje tę wiadomość Alexowi i Bailey. To dzięki niej Stevens rozpoczyna leczenie.
Szósty sezon to dla Yang trudny okres burzliwego związku z Huntem. Po zatrudnieniu dr Teddy Altman, koleżanki Owena z Iraku, Cristina ma wątpliwości co do bycia z nim. Podejrzewa ona, iż Owen kocha Teddy i nie zgadza się z nim zamieszkać. Po napadzie Gary’ego Clarka, podejmuje się ona torakotomii postrzelonego Dereka. Asystuje jej Jackson Avery. Kiedy uzbrojony napastnik wchodzi na salę operacyjną, Owen usiłuje ratować Cristinę i zostaje postrzelony.