Opisywany jako przyjacielski, energiczny mężczyzna, niewysokiego wzrostu (mierzył 166 cm). W 1916 roku dodał panieńskie nazwisko matki (Hartz) do swojego nazwiska. Napisał autobiografię w 1920 rokuvon Waldeyer-Hartz W: Lebenserinnerungen. Bonn: Cohen, 1920..

thumb|Maska pośmiertna Waldeyera, zdjęcie z gabloty w Instytucie Anatomii Uniwersytetu Berlińskiego (2008 rok) thumb|Dłonie Waldeyera. Dłonie nie zachowały się po II Wojnie Światowej. Zdjęcie jest pokazywane (2008) w gablocie na korytarzu w Instytucie Anatomii Uniwersytetu Berlińskiego Zmarł 23 stycznia 1921 roku w Berlinie.

Był członkiem Niemieckiego Towarzystwa Antropologicznego (Deutschen Anthropologischen Gesellschaft, od 1869), Niemieckiej Akademii Przyrodników Leopoldina (niem. Deutschen Akademie der Naturforscher Leopoldina) (od 1879), Gesellschaft für Natur- und Heilkunde in Berlin (od 1884), Pruskiej Akademii Nauk (Königlich Preußischen Akademie der Wissenschaften, od 1884)Biografie, Wilhelm von Waldeyer-Hartz Katalog der wissenschaftlichen Sammlungen der Humboldt-Universität zu Berlin .