Merson czuł się już za stary na powrót do Premier League i chciał wrócić do swojego domu w Londynie. Z jego usług skorzystało Walsall F.C. w lecie 2003. Nie skończyły się jednak jego problemy. W lutym 2004, poprosił o pomoc klinikę Sierra Tucson w Arizonie w sprawie jego uzależnienia od hazardu i opuścił kilka kluczowych gier. Gdy Jego drużyna bardzo słabo radziła sobie w lidze dostał on propozycje trenowania tego zespołu. Sprawił, że waleczna drużyna walczyła o utrzymanie, niestety po przegranej z Crystal Palace i wygranej 3-2 z Rotherham United musieli opierać się na wygranej Stoke City. Mimo degradacji Paul zachował posadę.
2004/2005 był trudnym sezonem dla Mersona. Walsall odpadł we wszystkich pucharach przeciwko słabszym drużynom, poinformowano także, że rozwodzi się ze swoją żoną. Zaczął znowu pić, powrócił do hazardu. Mark Bosnich zaproponował mu jednak pomoc, by postawić go na nogi. Uszczęśliwiony Merson zgodził się na to. Walsall kupiło w oknie transferowym Juliana Joachima, Andy Oakes, Anthony Gerrarda (kuzyn Stevena Gerrarda), Craig Peada i Davida Perpetuini. Zespół Mersona utrzymał się w League One.