W 1995 roku fabryka uzyskała jako pierwsze w Polsce przedsiębiorstwo branży motoryzacyjnej certyfikat DIN ISO 9002. Rok później spółka wydzierżawiła halę od Zakładów H. Cegielskiego w Poznaniu i utworzyła w niej odlewnię. W 2001 roku otwarto Zakład nr 2 – Zakład Budowy Samochodów Specjalnych przy ul. św. Michała w Poznaniu.
W 2003 roku w fabryce rozpoczęto produkcję modelu T5 oraz Caddy. Wprowadzenie do produkcji modelu Caddy wiązało się z rozbudową fabryki o kolejne zakłady, m.in. w Swarzędzu-Jasinie i zwiększeniem jego łącznych mocy produkcyjnych z około 40–50 tys. do około 170 tys. W 2005 roku w porozumieniu z Zespołem Szkół Ponadgimnazjalnych nr 1 w Swarzędzu otwarto klasę o profilu Monter Mechatronik. 11 grudnia 2007 roku świętowano wyprodukowanie w fabryce milionowego samochodu, którym był Caddy w wersji Maxi Furgon. W 2010 roku Volkswagen Poznań zakupił od Zakładów H. Cegielskiego nieruchomość gruntową, którą w 1996 roku wydzierżawił.