Najbardziej znane to NFS, Coda, AFS (System plików Andrewsa), SMB oraz NCP (Novella). Specjalne systemy plików (Wirtualne systemy plików) – nie umożliwiają zarządzania danymi, np. system /proc (w Linuksie) dostarcza interfejs, który umożliwia dostęp do niektórych struktur jądra. Systemy oparte na bazie danych – systemy plików, w których pliki są identyfikowane na podstawie swojej charakterystyki (np. autora, typu czy tematu, którego dotyczą) – jak w bazach danych.
Popularne systemy plików Poniższa lista jest podzielona ze względu na oryginalny system, dla którego były zaprojektowane. W chwili obecnej wiele systemów plików można obsługiwać w więcej niż jednym systemie operacyjnym (np. FAT, ISO 9660, NTFS, ext2, ZFS, SMB, NFS, JFS, XFS, UFS,...)
Unix/Linux SYSV (system plików z Unix-V, firmy AT&T) Berkeley Fast File System (FFS) Poprzednik UFS UFS (uniksowy system plików pod Solarisa i BSD) minix (system prof. Andrew S.