13 grudnia 2009 został także członkiem komisji śledczej do zbadania sprawy zarzutu nielegalnego wywierania wpływu na funkcjonariuszy policji, służb specjalnych, prokuratorów i osoby pełniące funkcje w organach wymiaru sprawiedliwości.

Przewodniczył PO w powiecie kędzierzyńsko-kozielskim, zasiadał we władzach krajowych partii. W marcu 2011 regionalny sąd koleżeński PO pozbawił Roberta Węgrzyna z członkostwa w partii po jego publicznej wypowiedzi na temat osób homoseksualnych: Z gejami to dajmy sobie spokój, ale z lesbijkami, to chętnie bym popatrzył (...). Wypowiedź miała być cytatem z prywatnej wypowiedzi Andrzeja Czumy o charakterze żartobliwym. Robert Węgrzyn odwołał się od tej decyzji do krajowego sądu koleżeńskiego, który w maju tego samego roku podtrzymał decyzję o wykluczeniu go z PO. Poseł wystąpił następnie z klubu parlamentarnego tej partii, zrezygnował także z członkostwa w komisji śledczej (został odwołany z jej składu 9 czerwca 2011). W 2011 jako niezależny bez powodzenia ubiegał się o mandat senatora. W 2014 powołał komitet Razem z Robertem Węgrzynem w wyborach do rady Kędzierzyna-Koźla i został zarejestrowany jako jego kandydat na prezydenta miasta. Wycofał jednak swoją kandydaturę z powodu choroby.