W ramach restrukturyzacji KLM, listopadzie 2002 w skład KLM Cityhopper włączone zostały inne regionalne spółki zależne (między innymi KLM uk). W rezultacie linia przejęła 5 baz operacyjnych wraz z załogami, które kontynuują obsługę połączeń między Amsterdamem a kierunkami na Wyspach Brytyjskich.
Obecnie linia jest w całości własnością KLM i zatrudniała 910 pracowników (stan na marzec 2007).
Połączenia KLM Cityhopper mały|Embraer 175 mały|Embraer 190 Wśród miejsc docelowych KLM Cityhopper obsługiwanych z hubu w Amsterdamie, znajdują się: 1 raz dziennie Warszawa, 2 razy dziennie Kraków (samolotem Embraer 190), od 15 maja 2017 także codzienne połączenie do Gdańska (Embraer 190) a od 30 marca 2025 KLM oferuje dwa loty dziennie do Poznania (Embraer 175). Niektóre z połączeń są obsługiwane zarówno przez KLM Cityhopper jak i przez KLM. mały|Fokker 50 mały|prawo|Fokker 70, Port lotniczy Leeds/Bradford. mały|Fokker 100 MiastoPaństwoLotniskoUwagiAalborgDaniaPort lotniczy AalborgAlesundNorwegiaPort lotniczy AalesundAberdeenWielka BrytaniaPort lotniczy AberdeenAmsterdamHolandiaPort lotniczy Amsterdam-SchipholHubBazylea Miluza FryburgSzwajcaria Francja NiemcyPort lotniczy EuroAirport Bazylea-Miluza-FryburgBelfastWielka BrytaniaPort lotniczy Belfast-InternationalBergenNorwegiaPort lotniczy BergenBerlinNiemcyPort lotniczy