W grudniu 1849 roku zainicjował utworzenie w Würzburgu „Societas physico-medica“ (), którego celem było promowanie wszystkich przedmiotów medycznych i nauk przyrodniczych Inicjatorami byli: anatom Albert Kölliker, patolog Rudolf Virchow (również uczeń P.E. Müllera), farmakolog i organizator naukowy Franz von Rinecker oraz chemik kliniczny Johann Joseph von Scherer. Dnia 8 grudnia 1849 roku, na inauguracyjnym posiedzeniu stowarzyszenia, Kölliker został wybrany jego pierwszym przewodniczącym.
Stowarzyszenie organizowało prezentacje i spotkania dyskusyjne dla pracowników naukowych, lekarzy, studentów i innych zainteresowanych. Rosnąca popularność Uniwersytetu w Würzburgu sprawiła, że w 1852 roku podjął tam studia m.in. Ernst Haeckel (ur. 1834). W 1896 roku publiczną prezentację promieniowania X przeprowadził jego odkrywca, Wilhelm Röntgen. Wykonał m.in. rentgenogram ręki Alberta Köllikera, który zaproponował nową nazwę tajemniczego „promieniowania X” – promieniowanie rentgenowskie.