Działalność charytatywna Był jednym z inicjatorów powstania Comic Relief, organizacji charytatywnej założonej przez ludzi ze środowiska brytyjskiej komedii. Wciąż bierze czynny udział w jej działalności, będąc jedną z gwiazd organizowanego co dwa lata specjalnego maratonu telewizyjnego, stanowiącego ukoronowanie tzw. Dnia Czerwonego Nosa, czyli zbiórki pieniędzy prowadzonej przez Comic Relief. Na potrzeby tego maratonu powstał odcinek specjalny Czarnej Żmii (Cavalier Years, rozgrywający się w czasach Cromwella) oraz kilka dodatkowych odsłon Jasia Fasoli, m.in. parodia programu telewizyjnego Randka w ciemno, w której Fasola wygrywa wycieczkę z dopiero co poznaną kobietą.
Życie prywatne Życie prywatne mały|Atkinson (2009) W latach 1990–2015 żoną Atkinsona była Sunetra Sastry, którą poznał, gdy pracowała dla BBC jako makijażystka. Mają dwoje dzieci; Benjamina i Lily. W lutym 2014 para się rozstała, a w listopadzie 2015 londyński sąd, po rozprawie trwającej niewiele ponad minutę, orzekł rozwód Atkinsona i Sastry. Według doniesień prasowych powodem rozpadu małżeństwa było wejście Atkinsona w nowy związek ze znacznie od niego młodszą aktorką .