Władze Zarząd Stowarzyszenia wybierany jest na trzyletnią kadencję, przez Walne Zgromadzenie członkiń i członków Towarzystwa. Organem kontrolnym jest Komisja Rewizyjna. Zarząd i Komisja Rewizyjna nie pobierają wynagrodzenia z tego tytułu pełnionych funkcji.
Najważniejsze projekty „INTERFAITH And Interethnic Coalition-Building To Combat Xenophobia And Religious-Based Discrimination” (2017-2018), jako organizacja partnerska Stowarzyszenie współpracowało z National Democratic Institute (NDI) i European Network Against Racism (ENAR). Celem projektu było budowanie koalicji na rzecz działalności rzeczniczej i strażniczej pomiędzy mniejszościami narodowymi i etnicznymi z Czech, Węgier, Polski i Słowacji. „Współczesne wyzwania stojące przed społecznością żydowską w Polsce” (2019) ogólnopolska konferencja organizacji żydowskich zorganizowana w partnerstwie z American Jewish Committee Central Europe (AJC), Gminą Wyznaniową Żydowską w Łodzi, Gminą Wyznaniową Żydowską w Warszawie oraz Gminą Wyznaniową Żydowską we Wrocławiu. Wydarzenie otrzymało patronat Związku Gmin Wyznaniowych Żydowskich w RP oraz Rzecznika Praw Obywatelskich. Konferencja odbyła się w Biurze Rzecznika Praw Obywatelskich oraz w Biurze Instytucji Demokratycznych i Praw Człowieka ODIHR/OSCE.