Latem 2006 za 1,3 miliona euro Hilbert przeszedł do pierwszoligowego VfB Stuttgart, do którego ściągnął go trener klubu, Armin Veh. W Stuttgarcie Hilbert zadebiutował 12 sierpnia w przegranym 0:3 meczu z 1. FC Nürnberg. Szybko stał się zawodnikiem pierwszego składu oraz jednym z czołowych zawodników VfB. 16 września w meczu z Werderem Brema, wygranym 2:3 najpierw zdobył samobójczego gola, a następnie trafił już do bramki przeciwników. W całym sezonie rozegrał wszystkie 34 ligowe mecze i zdobył w nich łącznie 7 goli (trzeci strzelec drużyny) i walnie przyczynił się do wywalczenia pierwszego od 15 lat mistrzostwa przez stuttgarcki klub.
W 2010 roku Hilbert przeszedł do Beşiktaşu JK. W sezonie 2010/2011 zdobył z nim Puchar Turcji. W Beşiktaşie grał do końca sezonu 2012/2013. Latem 2013 został zawodnikiem Bayeru 04 Leverkusen.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 2002/03 1. SC Feucht
Oberliga 22 10 2003/04 1. SC Feucht
Regionalliga 26 10 2004/05 SpVgg Greuther Fürth
2. Bundesliga 26 5 2005/06 SpVgg Greuther Fürth
2.