Z chwilą zamieszkania w niej Hitlera, kryptonim kwatery przemianowano na Werwolf. Podobnie jak w Wilczym Szańcu, samą kwaterę główną otaczały kwatery: Dowództwa Wojsk Lądowych – OKH (niem. Oberkommando des Heeres) w zaadaptowanych budynkach Uniwersytetu w Winnicy Dowództwa Floty Powietrznej – OKL (niem. Oberkommando der Luftwaffe) kryptonim Steinbruch Szefa Kancelarii Rzeszy (niem. Quartier des Chefs der Reichskanzlei) Lammersa Szefa SS i Gestapo (niem. Quartier des SS und Gestapo Chef) Himmlera Ministra Spraw Zagranicznych (niem. Residenz des Aussenministers) Ribbentropa Trzy ostatnie z wymienionych ulokowano pod kryptonimem "Hegewald" w jednym miejscu, u wylotu z Żytomierza w kierunku Winnicy.
thumb|Pozostałości po jedynym bunkrze kwatery Adolf Hitler przebywał w FHQ Werwolf trzykrotnie: 16.07 – 30.10.1942 19.02 – 13.03.1943 27.08.1943 (niecały dzień)
Przed opuszczeniem Niemcy zniszczyli naziemne obiekty, nie mniej przez następnych 40 lat Armia Czerwona systematycznie równała wszystko z ziemią, a w podziemnych korytarzach detonowano niewypały. Jedyne widoczne do dziś ślady to basen, fragmenty rozstrzelonego na dużej powierzchni bunkra i zejścia do podziemnych tuneli.