6 września 1985 wraz z kilkunastoma posłami odszedł z ND, założył wówczas partię DIANA. Ugrupowanie to nie odnosiło wyborczych sukcesów; Konstandinos Stefanopulos kierował nim do 1994, kiedy to partia ta zawiesiła swoją działalność.
8 marca 1995 został wybrany przez grecki parlament na urząd prezydenta. Jego kandydaturę wysunęła Wiosna Polityczna, a zaaprobował również socjalistyczny PASOK. W głosowaniu poparło go 181 parlamentarzystów. Stanowisko objął 10 marca 1995, zastępując Konstandinosa Karamanlisa. 8 lutego 2000 wybrany na drugą kadencję 269 głosami posłów PASOK-u i Nowej Demokracji. Zakończył urzędowanie 12 marca 2005, gdy na prezydenta został zaprzysiężony jego następca Karolos Papulias.
Konstandinos Stefanopulos był żonaty, jego małżonka zmarła przed nim. Miał troje dzieci.
Odznaczenia Jako prezydent z urzędu (ex officio) był wielkim mistrzem orderów: Zbawiciela, Jerzego I, Honoru, Feniksa i Dobroczynności.