Z biegiem czasu lotnisko pokazało sygnały słabości, brak miejsca dla pasażerów i przestarzałą technologię w radarach i bezpieczeństwie. W 2001 r. w celu usprawnienia i rozbudowy jego infrastruktury, lotnisko uzyskało weszło w skład Lima Airport Partners (LAP), obecnie składa się z Fraport i dwóch innych drobnych partnerów, zachowując kontrolę ruchu lotniczego zarządzaną przez CORPACLima Airport Partners..

Rozbudowa W lutym 2005 roku pierwszy etap renowacji i projekt rozbudowy został zakończony, w tym Peru Plaza Shopping Center i nowa hala. W czerwcu 2007 roku czterogwiazdkowy hotel został otwarty przed terminalem „Ramada Costa del Sol”. W styczniu 2009 roku, drugi etap rozbudowy terminalu został otwarty. Obecnie terminal ma 28 bramek, z czego 19 z rękawami. W sierpniu 2009 roku, Port lotniczy Lima-Jorge Chávez poinformował, że powinien otrzymać nowe ILS CAT III w 2010 roku, co pomoże podczas lądować w czasie mgieł.. Budowa drugiego pasa startowego to kolejny bardzo ważny projekt i ma być zakończony w 2014 r. Turystyczy i handlowy ruch pasażerski wzrósł w Peru dramatycznie, a przewiduje się podwoić w 2011 r. Tempo wzrostu jest wyższe niż gdziekolwiek indziej w Ameryce Łacińskiej.