w sprawie nadania statutu Głównemu Inspektoratowi Ochrony Środowiska (): Departament Inspekcji Departament Kontroli Odpadów Departament Transgranicznego Przemieszczania Odpadów Departament Monitoringu Środowiska Departament Zwalczania Przestępczości Środowiskowej Departament Prawny Departament Administracyjno-Finansowy Departament Informatyzacji Centralne Laboratorium Badawcze Krajowe Laboratorium Referencyjne do spraw jakości powietrza atmosferycznego Krajowe Laboratorium Referencyjne do spraw jakości wód powierzchniowych Biuro Dyrektora Generalnego Zespół do spraw Kontroli i Audytu.
Wcześniej GIOŚ tworzyły inne jednostki. W 1999 były toRozporządzenie Prezesa Rady Ministrów z dnia 6 kwietnia 1999 r. w sprawie nadania statutu Głównemu Inspektoratowi Ochrony Środowiska (): Zespół Inspekcji i Orzecznictwa Zespół Monitoringu Zespół Przeciwdziałania Nadzwyczajnym Zagrożeniom Środowiska Zespół Organizacyjny Zespół Ekonomiczno-Administracyjny.
Od 2023 przy GIOŚ funkcjonuje rada naukowa.
Inspekcja Ochrony Środowiska
Inspekcja Ochrony Środowiska to dwuinstancyjna instytucja, podległa ministrowi właściwemu ds.