Do 2020 przy szopce mieszkał żywy osioł o imieniu „Franek”, obecnie przebywa tam muł „Franciszek II”.
Na przełomie 2006 i 2007 zaprezentował w Zachęcie Narodowej Galerii Sztuki „Arkę” – bestiarium wykonane z drewna i blachy, odwołujące się do biblijnej Arki Noego. Początkowo było to dzieło zainstalowane na ścianie. W 2016 zostały dobudowane części boczne i tył instalacji, a całość umieszczono na terenie dawnego folwarku, wchodzącego obecnie w skład Zespołu pałacowo-parkowego w Radziejowicach. Na terenie tym została umieszczona także inna praca artysty – „Brama Teatru Narodowego”. Jest to oryginalna brama Teatru, którą ówczesny dyrektor Domu Pracy Twórczej w Radziejowicach, Bogumił Mrówczyński, uratował przed złomowaniem powierzając ją twórczej obróbce Józefa Wilkonia.
W grudniu 2009 powstała Fundacja „Arka” im. Józefa Wilkonia (Prezes: Blanka Wyszyńska-Walczak, ur. 1963), której celem jest „ochrona i promocja dorobku artystycznego Józefa Wilkonia i ogólnych wartości związanych ze sztukami pięknymi, a w szczególności ilustratorstwem i sztuką edytorską”.