Piąta seria (22 odcinki) Brennan i Booth prowadzą kolejne śledztwa w sprawach morderstw. Zawsze udaje im się złapać sprawcę.Po kilku latach ujawniają Sweetsowi, co ich łączyło (i łączy). Skłania ich do tego książka, w której Sweets opisał partnerstwo według jego obserwacji, które częściowo odbiegały od prawdy. Młody psycholog jest zadowolony z ich decyzji, lecz jednocześnie przygnębiony faktem, iż jego książka jest do niczego. Okazuje się, że Brennan i Booth na początku znajomości mieli krótkotrwały romans. Później każde z nich próbowało iść w swoją stronę, ale bez powodzenia. Po zakończonej rozmowie ze Sweetsem Booth mówi Brennan o jego uczuciach do niej i udowadnia pocałunkiem. Kończy się to jednak zniesmaczeniem Temperance, która nie chce łączyć spraw zawodowych z prywatnymi. Obiecuje jednak, że zostanie pomiędzy nimi silna więź. Po kilku miesiącach Seeley dostaje propozycję powrotu do wojska. Zastanawia się nad tym, choć ma wyrzuty sumienia - wielokrotnie powtarzał przyjaciołom i synowi, że więcej tam nie wróci. Chce jednak jechać do Afganistanu, by znowu pomagać ludziom chociaż przez krótki okres. Dzieli się przemyśleniami z Brennan, która karci go. Po pewnym czasie jednak i ona dostaje propozycję wyjazdu poza granice państwa, aby przeprowadzać badania. Było to jej skrytym marzeniem, więc postanawia pojechać.